Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC61Q9Y6R9 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC61Q9Y6R9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms