Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HPS5Q9UPZ3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HPS5Q9UPZ3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms