Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNX7Q9UNH6 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNX7Q9UNH6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms