Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SYNRGQ9UMZ2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SYNRGQ9UMZ2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms