Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
BRPF3Q9ULD4 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
BRPF3Q9ULD4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms