Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL19

RARRES3, Retinoic acid receptor responder protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARRES3Q9UL19 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RARRES3Q9UL19 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RARRES3Q9UL19 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms