Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CFAP45Q9UL16 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CFAP45Q9UL16 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms