Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RPUSD1Q9UJJ7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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