Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PLXNA1Q9UIW2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PLXNA1Q9UIW2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms