Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI42

CPA4, Carboxypeptidase A4, humanhuman

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA4Q9UI42 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CPA4Q9UI42 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPA4Q9UI42 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
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