Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLN8Q9UBY8 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms