Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ZNRD1Q9P1U0 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms