Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W2

HMG20B, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1-related, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20BQ9P0W2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HMG20BQ9P0W2 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms