Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT82Q9NSB4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
KRT82Q9NSB4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms