Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR4

DROSHA, Ribonuclease 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DROSHAQ9NRR4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.71e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.691e-15■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PPIF-202ENST00000448165 821 ntTSL 223.91■■□□□ 1.421e-15■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.341e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 RAB4B-EGLN2-202ENST00000596216 624 ntTSL 320.48■□□□□ 0.871e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 TUBA1C-203ENST00000548470 1105 ntTSL 217.85■□□□□ 0.451e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PCBD2-202ENST00000504352 961 ntTSL 516.18■□□□□ 0.181e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.651e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.352e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.042e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.692e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.342e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 TCF25-221ENST00000568409 857 ntTSL 321.17■□□□□ 0.981e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 ATN1-202ENST00000396684 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.253e-9■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 AP5Z1-202ENST00000469614 2337 ntTSL 224.67■■□□□ 1.542e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 AP5Z1-204ENST00000477680 3081 ntTSL 219.89■□□□□ 0.782e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 AP5Z1-207ENST00000496303 5660 ntTSL 219.89■□□□□ 0.772e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.752e-6■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.148e-10■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 MAGEC2-201ENST00000247452 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.388e-10■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 AGO1-202ENST00000373206 3996 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.748e-10■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 AGO1-201ENST00000373204 13708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.148e-10■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 423.98■■□□□ 1.438e-7■■■□□ 15.1
DROSHAQ9NRR4 FAM178B-205ENST00000494172 592 ntTSL 327.74■■■□□ 2.033e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 FAM178B-202ENST00000470789 722 ntTSL 1 (best)17.52■□□□□ 0.393e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ELOVL5-204ENST00000465983 696 ntTSL 319.56■□□□□ 0.724e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ELOVL5-206ENST00000486973 794 ntTSL 319.44■□□□□ 0.74e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.524e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ELOVL5-205ENST00000485336 761 ntTSL 516.01■□□□□ 0.154e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.534e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ELOVL5-207ENST00000542638 2875 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.554e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ELOVL5-203ENST00000370918 3081 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.014e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.875e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.262e-11■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 PRMT7-211ENST00000563608 626 ntTSL 522.54■■□□□ 1.25e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.155e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.935e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.465e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 PRMT7-223ENST00000567542 3542 ntTSL 1 (best)17.71■□□□□ 0.435e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 PRMT7-225ENST00000568975 2996 ntTSL 216.34■□□□□ 0.215e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 FARP1-224ENST00000598389 747 ntTSL 510.73□□□□□ -0.695e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.512e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 MICALL2-204ENST00000467394 2080 ntTSL 229.57■■■□□ 2.325e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-209ENST00000507139 472 ntTSL 433.89■■■■□ 3.021e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-206ENST00000504844 777 ntTSL 232.7■■■□□ 2.831e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-203ENST00000502336 581 ntTSL 430.76■■■□□ 2.511e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.841e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 CXXC5-216ENST00000520967 878 ntTSL 324.22■■□□□ 1.471e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.951e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ENTPD6-217ENST00000485936 2588 ntTSL 221.94■■□□□ 1.11e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ENTPD6-216ENST00000481322 414 ntTSL 319.24■□□□□ 0.671e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 LDB1-204ENST00000490751 762 ntTSL 248.22■■■■■ 5.312e-10■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 ZNF316-203ENST00000614588 939 ntTSL 332.57■■■□□ 2.85e-8■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-207ENST00000527468 571 ntTSL 230.53■■■□□ 2.483e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.773e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.713e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-216ENST00000532373 620 ntTSL 325.37■■□□□ 1.653e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-210ENST00000528357 500 ntTSL 423.91■■□□□ 1.423e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.333e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-205ENST00000526982 965 ntTSL 322.32■■□□□ 1.163e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-213ENST00000530889 563 ntTSL 220.61■□□□□ 0.893e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.33e-6■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-210ENST00000498186 1876 ntTSL 237.01■■■■□ 3.521e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-207ENST00000483012 1491 ntTSL 236.69■■■■□ 3.461e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.161e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.661e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-209ENST00000492143 3641 ntTSL 221.85■■□□□ 1.091e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.871e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-7■■■□□ 15
DROSHAQ9NRR4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.1■■■■■ 4.336e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-215ENST00000439101 779 ntTSL 540.29■■■■■ 4.046e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-209ENST00000424537 781 ntTSL 239.71■■■■□ 3.956e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-210ENST00000426941 575 ntTSL 235■■■■□ 3.196e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-219ENST00000452891 575 ntTSL 435■■■■□ 3.196e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-214ENST00000436917 499 ntTSL 432.54■■■□□ 2.86e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-227ENST00000483603 572 ntTSL 532.54■■■□□ 2.86e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-207ENST00000420551 395 ntTSL 531.95■■■□□ 2.716e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-213ENST00000436402 600 ntTSL 531.39■■■□□ 2.626e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.616e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-217ENST00000442307 923 ntTSL 231.04■■■□□ 2.566e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.516e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.426e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-211ENST00000429279 580 ntTSL 428.09■■■□□ 2.096e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-232ENST00000495372 561 ntTSL 227.99■■■□□ 2.076e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.896e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-216ENST00000440109 935 ntTSL 322.73■■□□□ 1.236e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.16e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.876e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-220ENST00000461760 644 ntTSL 318.22■□□□□ 0.516e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 STK25-206ENST00000413760 801 ntTSL 315.49■□□□□ 0.076e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.497e-45■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBB-206ENST00000577958 376 ntTSL 223.89■■□□□ 1.417e-45■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBB-207ENST00000578649 477 ntTSL 520.03■□□□□ 0.87e-45■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBB-205ENST00000577640 724 ntTSL 516.51■□□□□ 0.237e-45■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBB-204ENST00000535788 704 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.157e-45■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 AGAP3-205ENST00000463381 2730 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.516e-8■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 AHDC1-205ENST00000490295 511 ntTSL 525.08■■□□□ 1.618e-7■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBC-210ENST00000541645 548 ntTSL 227.51■■□□□ 1.997e-46■■■□□ 14.9
DROSHAQ9NRR4 UBC-207ENST00000540351 622 ntTSL 1 (best)21.17■□□□□ 0.987e-46■■■□□ 14.9
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