Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DUOX1Q9NRD9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms