Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR99

MXRA5, Matrix-remodeling-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MXRA5Q9NR99 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MXRA5Q9NR99 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
MXRA5Q9NR99 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms