Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ASCL3Q9NQ33 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ASCL3Q9NQ33 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms