Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GPCPD1Q9NPB8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms