Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP72

RAB18, Ras-related protein Rab-18, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB18Q9NP72 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
RAB18Q9NP72 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
RAB18Q9NP72 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms