Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6S0

YTHDC2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC2Q9H6S0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
YTHDC2Q9H6S0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
YTHDC2Q9H6S0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms