Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0D2

ZNF541, Zinc finger protein 541, humanhuman

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF541Q9H0D2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ZNF541Q9H0D2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ZNF541Q9H0D2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms