Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BCL11BQ9C0K0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms