Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY65

NPCDR1, Nasopharyngeal carcinoma down-regulated gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPCDR1Q9BY65 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NPCDR1Q9BY65 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms