Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW4

SSBP3, Single-stranded DNA-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP3Q9BWW4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SSBP3Q9BWW4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms