Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL5

PHF23, PHD finger protein 23, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23Q9BUL5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 CD24P2-201ENST00000565486 219 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AP001099.1-201ENST00000579385 855 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PHF23Q9BUL5 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 MRPL47-202ENST00000392659 673 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 ATP6AP2-202ENST00000423649 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 OR4A48P-201ENST00000531359 391 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 C11orf65-203ENST00000525729 1263 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 NPM1P31-201ENST00000399021 764 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AL590004.3-201ENST00000450255 443 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC009630.2-201ENST00000524133 570 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC009630.2-202ENST00000578500 884 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PHF23Q9BUL5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms