Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTX1

NDC1, Nucleoporin NDC1, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC1Q9BTX1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NDC1Q9BTX1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms