Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRS8

LARP6, La-related protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP6Q9BRS8 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LARP6Q9BRS8 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms