Protein–RNA interactions for Protein: Q99928

GABRG3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRG3Q99928 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GABRG3Q99928 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GABRG3Q99928 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms