Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PITX2Q99697 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PITX2Q99697 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms