Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NUP88Q99567 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms