Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CICQ96RK0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CICQ96RK0 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms