Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ARXQ96QS3 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
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