Protein–RNA interactions for Protein: Q96NK8

NEUROD6, Neurogenic differentiation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD6Q96NK8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NEUROD6Q96NK8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NEUROD6Q96NK8 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms