Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG8

PCMTD1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMTD1Q96MG8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PCMTD1Q96MG8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PCMTD1Q96MG8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms