Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM47Q96LD4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms