Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LINC02349-201ENST00000561386 963 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AP003108.4-201ENST00000623917 878 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms