Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP9

SLC10A4, Sodium/bile acid cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A4Q96EP9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC10A4Q96EP9 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC10A4Q96EP9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms