Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TMIGD2Q96BF3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms