Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RFT1Q96AA3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RFT1Q96AA3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms