Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
NKD1Q969G9 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms