Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF3C6Q969F1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C6Q969F1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms