Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HLA-CQ95604 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HLA-CQ95604 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms