Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TNRQ92752 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TNRQ92752 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TNRQ92752 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TNRQ92752 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TNRQ92752 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms