Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DDX54Q8TDD1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
DDX54Q8TDD1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms