Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBW4

SLC38A9, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A9Q8NBW4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC38A9Q8NBW4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC38A9Q8NBW4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms