Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM87AQ8NBN3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM87AQ8NBN3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms