Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
AMER3Q8N944 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms