Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SMIM20Q8N5G0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SMIM20Q8N5G0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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