Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8N3U1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Q8N3U1 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 UBE2Q2P6-202ENST00000617217 443 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Q8N3U1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Q8N3U1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Q8N3U1 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8N3U1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8N3U1 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8N3U1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8N3U1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Q8N3U1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms